Gráficos con ggplot2: Primeras ideas

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#### ITA (módulo práctico)

## Gráficos con ggplot2: Primeras ideas

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### Pedro J. Pérez

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#### e-mail: [<svg viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M464 64H48C21.49 64 0 85.49 0 112v288c0 26.51 21.49 48 48 48h416c26.51 0 48-21.49 48-48V112c0-26.51-21.49-48-48-48zm0 48v40.805c-22.422 18.259-58.168 46.651-134.587 106.49-16.841 13.247-50.201 45.072-73.413 44.701-23.208.375-56.579-31.459-73.413-44.701C106.18 199.465 70.425 171.067 48 152.805V112h416zM48 400V214.398c22.914 18.251 55.409 43.862 104.938 82.646 21.857 17.205 60.134 55.186 103.062 54.955 42.717.231 80.509-37.199 103.053-54.947 49.528-38.783 82.032-64.401 104.947-82.653V400H48z"></path></svg>](mailto:pedro.j.perez@uv.es) [pedro.j.perez@uv.es](mailto:pedro.j.perez@uv.es)

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## Gráficos chulos con *ggplot2*

#### Uno de los mejores (que dices!?, el MEJOR!!!) sistema gráfico del MUNDO.

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background-size: 5%

##### el análisis gráfico es fundamental

- El **análisis gráfico es fundamental** al presentar resultados, pero también en el análisis exploratorio: permite descubrir relaciones entre variables, y descartar o sugerir nuevas preguntas sobre los datos.

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- R tiene varios sistemas gráficos, pero **usaremos ggplot2**

- *ggplot2* es un paquete de R para producir gráficos estadísticos. Bueno, en realidad **es todo un ecosistema**. Mira sus extensiones [[aquí]](https://exts.ggplot2.tidyverse.org/gallery/).

- Es diferente porque tiene una **gramática subyacente**, basada en Grammar of Graphics (Wilkinson 2005).

- Cuesta un poco (sólo un poco) más empezar, pero enseguida se ven los beneficios; además, es que **ahora mismo es el estándar**.

---
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background-size: 10%

## Primeras ideas sobre *ggplot2*

#### Primeras ideas para empezar a familiarizarnos con *ggplot2*

---
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background-size: 5%

##### ¿qué vemos en el gráfico de abajo?

.pull-left[
<img src="data:image/png;base64,#slides_06_ggplot2_A_files/figure-html/unnamed-chunk-5-1.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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- gráfico de puntos

- se representan 3 variables:

- Sepal.Length en el **eje X**

- Petal.Length en el **eje Y**

- Species en el **color de los puntos**
]

##### Importante para entender ggplot2 [ 🌟 ]

Un gráfico tiene 3 componentes principales:
  
  - los **datos** que se van a representar  (.orange[ggplot()] )

- un conjunto de **propiedades estéticas asociadas a variables** del conjunto de datos. Por ejemplo, la posición en el eje X esta asociada a la variable Sepal.Length, el color de los puntos está asociado a los valores de la variable Species.  (  .orange[aes()] )

- el **elemento geométrico que se va a representar**. En nuestro caso son  puntos (.orange[geom_point()] ), pero podrían haber sido las lineas (.orange[geom_line()] ) o ...

---

##### sintaxis de ggplot2 [ 🌟 ]

``` r
ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, 
                        y = Petal.Length, 
                        color = Species)) + 
    geom_point()
```

--
##### Forma más compacta de escribirlo

``` r
ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length, 
                         color = Species)) + geom_point()
```

---

##### poniendo los nombres de todos los argumentos

##### quedaría  como ....

``` r
ggplot(data = iris, 
       mapping = aes(x = Sepal.Length, 
                     y = Petal.Length, 
                     color = Species) ) + 
    geom_point()
```

---

``` r
*iris
```
]
 
.panel2-grafico-00-auto[

```
#>     Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width    Species
#> 1            5.1         3.5          1.4         0.2     setosa
#> 2            4.9         3.0          1.4         0.2     setosa
#> 3            4.7         3.2          1.3         0.2     setosa
#> 4            4.6         3.1          1.5         0.2     setosa
#> 5            5.0         3.6          1.4         0.2     setosa
#> 6            5.4         3.9          1.7         0.4     setosa
#> 7            4.6         3.4          1.4         0.3     setosa
#> 8            5.0         3.4          1.5         0.2     setosa
#> 9            4.4         2.9          1.4         0.2     setosa
#> 10           4.9         3.1          1.5         0.1     setosa
#> 11           5.4         3.7          1.5         0.2     setosa
#> 12           4.8         3.4          1.6         0.2     setosa
#> 13           4.8         3.0          1.4         0.1     setosa
#> 14           4.3         3.0          1.1         0.1     setosa
#> 15           5.8         4.0          1.2         0.2     setosa
#> 16           5.7         4.4          1.5         0.4     setosa
#> 17           5.4         3.9          1.3         0.4     setosa
#> 18           5.1         3.5          1.4         0.3     setosa
#> 19           5.7         3.8          1.7         0.3     setosa
#> 20           5.1         3.8          1.5         0.3     setosa
#> 21           5.4         3.4          1.7         0.2     setosa
#> 22           5.1         3.7          1.5         0.4     setosa
#> 23           4.6         3.6          1.0         0.2     setosa
#> 24           5.1         3.3          1.7         0.5     setosa
#> 25           4.8         3.4          1.9         0.2     setosa
#> 26           5.0         3.0          1.6         0.2     setosa
#> 27           5.0         3.4          1.6         0.4     setosa
#> 28           5.2         3.5          1.5         0.2     setosa
#> 29           5.2         3.4          1.4         0.2     setosa
#> 30           4.7         3.2          1.6         0.2     setosa
#> 31           4.8         3.1          1.6         0.2     setosa
#> 32           5.4         3.4          1.5         0.4     setosa
#> 33           5.2         4.1          1.5         0.1     setosa
#> 34           5.5         4.2          1.4         0.2     setosa
#> 35           4.9         3.1          1.5         0.2     setosa
#> 36           5.0         3.2          1.2         0.2     setosa
#> 37           5.5         3.5          1.3         0.2     setosa
#> 38           4.9         3.6          1.4         0.1     setosa
#> 39           4.4         3.0          1.3         0.2     setosa
#> 40           5.1         3.4          1.5         0.2     setosa
#> 41           5.0         3.5          1.3         0.3     setosa
#> 42           4.5         2.3          1.3         0.3     setosa
#> 43           4.4         3.2          1.3         0.2     setosa
#> 44           5.0         3.5          1.6         0.6     setosa
#> 45           5.1         3.8          1.9         0.4     setosa
#> 46           4.8         3.0          1.4         0.3     setosa
#> 47           5.1         3.8          1.6         0.2     setosa
#> 48           4.6         3.2          1.4         0.2     setosa
#> 49           5.3         3.7          1.5         0.2     setosa
#> 50           5.0         3.3          1.4         0.2     setosa
#> 51           7.0         3.2          4.7         1.4 versicolor
#> 52           6.4         3.2          4.5         1.5 versicolor
#> 53           6.9         3.1          4.9         1.5 versicolor
#> 54           5.5         2.3          4.0         1.3 versicolor
#> 55           6.5         2.8          4.6         1.5 versicolor
#> 56           5.7         2.8          4.5         1.3 versicolor
#> 57           6.3         3.3          4.7         1.6 versicolor
#> 58           4.9         2.4          3.3         1.0 versicolor
#> 59           6.6         2.9          4.6         1.3 versicolor
#> 60           5.2         2.7          3.9         1.4 versicolor
#> 61           5.0         2.0          3.5         1.0 versicolor
#> 62           5.9         3.0          4.2         1.5 versicolor
#> 63           6.0         2.2          4.0         1.0 versicolor
#> 64           6.1         2.9          4.7         1.4 versicolor
#> 65           5.6         2.9          3.6         1.3 versicolor
#> 66           6.7         3.1          4.4         1.4 versicolor
#> 67           5.6         3.0          4.5         1.5 versicolor
#> 68           5.8         2.7          4.1         1.0 versicolor
#> 69           6.2         2.2          4.5         1.5 versicolor
#> 70           5.6         2.5          3.9         1.1 versicolor
#> 71           5.9         3.2          4.8         1.8 versicolor
#> 72           6.1         2.8          4.0         1.3 versicolor
#> 73           6.3         2.5          4.9         1.5 versicolor
#> 74           6.1         2.8          4.7         1.2 versicolor
#> 75           6.4         2.9          4.3         1.3 versicolor
#> 76           6.6         3.0          4.4         1.4 versicolor
#> 77           6.8         2.8          4.8         1.4 versicolor
#> 78           6.7         3.0          5.0         1.7 versicolor
#> 79           6.0         2.9          4.5         1.5 versicolor
#> 80           5.7         2.6          3.5         1.0 versicolor
#> 81           5.5         2.4          3.8         1.1 versicolor
#> 82           5.5         2.4          3.7         1.0 versicolor
#> 83           5.8         2.7          3.9         1.2 versicolor
#> 84           6.0         2.7          5.1         1.6 versicolor
#> 85           5.4         3.0          4.5         1.5 versicolor
#> 86           6.0         3.4          4.5         1.6 versicolor
#> 87           6.7         3.1          4.7         1.5 versicolor
#> 88           6.3         2.3          4.4         1.3 versicolor
#> 89           5.6         3.0          4.1         1.3 versicolor
#> 90           5.5         2.5          4.0         1.3 versicolor
#> 91           5.5         2.6          4.4         1.2 versicolor
#> 92           6.1         3.0          4.6         1.4 versicolor
#> 93           5.8         2.6          4.0         1.2 versicolor
#> 94           5.0         2.3          3.3         1.0 versicolor
#> 95           5.6         2.7          4.2         1.3 versicolor
#> 96           5.7         3.0          4.2         1.2 versicolor
#> 97           5.7         2.9          4.2         1.3 versicolor
#> 98           6.2         2.9          4.3         1.3 versicolor
#> 99           5.1         2.5          3.0         1.1 versicolor
#> 100          5.7         2.8          4.1         1.3 versicolor
#> 101          6.3         3.3          6.0         2.5  virginica
#> 102          5.8         2.7          5.1         1.9  virginica
#> 103          7.1         3.0          5.9         2.1  virginica
#> 104          6.3         2.9          5.6         1.8  virginica
#> 105          6.5         3.0          5.8         2.2  virginica
#> 106          7.6         3.0          6.6         2.1  virginica
#> 107          4.9         2.5          4.5         1.7  virginica
#> 108          7.3         2.9          6.3         1.8  virginica
#> 109          6.7         2.5          5.8         1.8  virginica
#> 110          7.2         3.6          6.1         2.5  virginica
#> 111          6.5         3.2          5.1         2.0  virginica
#> 112          6.4         2.7          5.3         1.9  virginica
#> 113          6.8         3.0          5.5         2.1  virginica
#> 114          5.7         2.5          5.0         2.0  virginica
#> 115          5.8         2.8          5.1         2.4  virginica
#> 116          6.4         3.2          5.3         2.3  virginica
#> 117          6.5         3.0          5.5         1.8  virginica
#> 118          7.7         3.8          6.7         2.2  virginica
#> 119          7.7         2.6          6.9         2.3  virginica
#> 120          6.0         2.2          5.0         1.5  virginica
#> 121          6.9         3.2          5.7         2.3  virginica
#> 122          5.6         2.8          4.9         2.0  virginica
#> 123          7.7         2.8          6.7         2.0  virginica
#> 124          6.3         2.7          4.9         1.8  virginica
#> 125          6.7         3.3          5.7         2.1  virginica
#> 126          7.2         3.2          6.0         1.8  virginica
#> 127          6.2         2.8          4.8         1.8  virginica
#> 128          6.1         3.0          4.9         1.8  virginica
#> 129          6.4         2.8          5.6         2.1  virginica
#> 130          7.2         3.0          5.8         1.6  virginica
#> 131          7.4         2.8          6.1         1.9  virginica
#> 132          7.9         3.8          6.4         2.0  virginica
#> 133          6.4         2.8          5.6         2.2  virginica
#> 134          6.3         2.8          5.1         1.5  virginica
#> 135          6.1         2.6          5.6         1.4  virginica
#> 136          7.7         3.0          6.1         2.3  virginica
#> 137          6.3         3.4          5.6         2.4  virginica
#> 138          6.4         3.1          5.5         1.8  virginica
#> 139          6.0         3.0          4.8         1.8  virginica
#> 140          6.9         3.1          5.4         2.1  virginica
#> 141          6.7         3.1          5.6         2.4  virginica
#> 142          6.9         3.1          5.1         2.3  virginica
#> 143          5.8         2.7          5.1         1.9  virginica
#> 144          6.8         3.2          5.9         2.3  virginica
#> 145          6.7         3.3          5.7         2.5  virginica
#> 146          6.7         3.0          5.2         2.3  virginica
#> 147          6.3         2.5          5.0         1.9  virginica
#> 148          6.5         3.0          5.2         2.0  virginica
#> 149          6.2         3.4          5.4         2.3  virginica
#> 150          5.9         3.0          5.1         1.8  virginica
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