Introducción al tidyverse

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#### Curso de introducción a R (SFPIE)

# Introducción al tidyverse

<br>

### Pedro J. Pérez

#### 2021, mayo

###### (actualizadas el 15-03-2024)

<br><br>
#### [<svg viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M464 64H48C21.49 64 0 85.49 0 112v288c0 26.51 21.49 48 48 48h416c26.51 0 48-21.49 48-48V112c0-26.51-21.49-48-48-48zm0 48v40.805c-22.422 18.259-58.168 46.651-134.587 106.49-16.841 13.247-50.201 45.072-73.413 44.701-23.208.375-56.579-31.459-73.413-44.701C106.18 199.465 70.425 171.067 48 152.805V112h416zM48 400V214.398c22.914 18.251 55.409 43.862 104.938 82.646 21.857 17.205 60.134 55.186 103.062 54.955 42.717.231 80.509-37.199 103.053-54.947 49.528-38.783 82.032-64.401 104.947-82.653V400H48z"></path></svg>](mailto:pedro.j.perez@uv.es) [pedro.j.perez@uv.es](mailto:pedro.j.perez@uv.es)
 
 
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}</style>

---
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### Historia reciente de R

<br>

#### R-base  vs.  tidyverse

---

##### Recientemente hubo a kind of revolution in <svg viewBox="0 0 581 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"></path></svg>: Hadley y el tidyverse

- R **era** un lenguaje "oscuro" para estadísticos y académicos, pero ...

- ... recientemente ha habido una especie de **revolución** en el universo <svg viewBox="0 0 581 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"></path></svg>

.pull-left[

- [Hadley Wickham](http://hadley.nz/), científico jefe de RStudio, [revolucionó el universo](https://priceonomics.com/hadley-wickham-the-man-who-revolutionized-r/?utm_campaign=Data%2BElixir&utm_medium=email&utm_source=Data_Elixir_46) <svg viewBox="0 0 581 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"></path></svg>, creando el '*Hadleyverse*'

]

.pull-right[

- El '*Hadleyverse*', se ha convertido en el [tidyverse](https://www.tidyverse.org/) gracias a un grupo de desarrolladores, por ejemplo:

<img src="data:image/png;base64,#./imagenes/ss_02_img_08_gente-tidyverse.jpg" width="95%" style="display: block; margin: auto;" />
]

---
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background-size: 6%

##### ¿qué es el tidyverse?

- Una nueva forma de escribir código y afrontar el análisis de datos con R.

- Según su propia página web, el [tidyverse](https://www.tidyverse.org/) es:

- **Traducido**, es un grupo de paquetes que se han diseñado con los mismos principios y que, por tanto, trabajan bien juntos y que han cambiado mucho, y a mejor, la forma de programar y afrontar el análisis de datos con R.

- Ahora mismo, el **tidyverse** [ya es el estándar](https://twitter.com/R_Hisp/status/1399635575712399360)

---
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background-size: 6%

##### R-base vs. tidyverse

- Podemos pensar que hay 2 formas de escribir código en <svg viewBox="0 0 581 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"></path></svg>: R-base y tidyverse.

- Nosotros escribiremos, principalmente, **à la tidyverse**.

- Escribir *à la tidyverse* [tiene ventajas](https://twitter.com/andrewheiss/status/1359583543509348356?ref_src=twsrc%5Etfw%7Ctwcamp%5Etweetembed%7Ctwterm%5E1359583543509348356%7Ctwgr%5E%7Ctwcon%5Es1_&ref_url=file%3A%2F%2F%2Fhome%2Fpjpv%2FEscritorio%2Fslides_curso-R_2021_ok%2Fslides_01_intro_a.html1) y, además, es que [ya es el estándar](https://twitter.com/R_Hisp/status/1399635575712399360)

<br>

##### tiene ventajas, p. ej ... la claridad y facilidad a la hora de leer el código.

- **R-base way**:

```r
leave_house(get_dressed(get_out_of_bed(wake_up(me, time = "8:00"), side = "correct"), 
                        pants = TRUE, shirt = TRUE), car = TRUE, bike = FALSE)
```

- **à la tidyverse** (el operador %>% se llama "the pipe"):

```r
me %>% 
  wake_up(time = "8:00") %>% 
  get_out_of_bed(side = "correct") %>% 
  get_dressed(pants = TRUE, shirt = TRUE) %>% 
  leave_house(car = TRUE, bike = FALSE)
```

---
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background-size: 4%

##### Pipe nativa (|>)

- La [versión 4.1.0 de R](https://www.jumpingrivers.com/blog/new-features-r410-pipe-anonymous-functions/) supuso la aparición de una **pipe nativa** en R: **|>**

- En la [versión 4.2.0](https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-devel/NEWS.html) se mejora la pipe nativa introduciendo un ["placeholder"](https://twitter.com/henrikbengtsson/status/1501306369319735300).

- Aún así, la pipe nativa tiene algunas [limitaciones](https://github.com/bwiernik/pipebind/). Puedes ver las diferencias entres las 2 pipe's [aquí](https://www.tidyverse.org/blog/2023/04/base-vs-magrittr-pipe/) y [aquí](https://ivelasq.rbind.io/blog/understanding-the-r-pipe/)

#####  ¿qué pasará en el futuro?

- Pues parece que ahora sí que [esto va en serio](https://twitter.com/hadleywickham/status/1519313737773158401?ref_src=twsrc%5Egoogle%7Ctwcamp%5Eserp%7Ctwgr%5Etweet%7Ctwtr%5Etrue)

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class: inverse, center, middle

### Investigación reproducible en el tidyverse

<br>

#### Desde el tidyverse se creó un ecosistema (Rmarkdown @ friends) para generar documentos reproducibles

---
background-image: url(data:image/png;base64,#imagenes/ss_00_new_logo_rmd.png)
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background-size: 5%

##### Tidyverse workflow e investigación reproducible

- Realizaremos **todas las etapas** de un análisis de datos **desde el entorno R**

<br>

- La última etapa, comunicar, se hacía con Rmarkdown ... hasta que llegó **Quarto**

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class:: inverse2

### Sé que todos somos mayores y muchos de nosotros profesores (o técnicos), pero aún así ... un par de consejos

<br>

#####  En serio!! Completamente en serio!!
 
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class: center

###  1. Es muy-muy importante la actitud!!!

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.pull-left[
##### Hay que intentar no agobiarse ...

<br>
.small[**Errores tontos**, we will have [a few](https://twitter.com/cogscimom/status/1354508785365078016/photo/1), well ... [a lot](https://twitter.com/WeAreRLadies/status/1523777331386458178). Es un poco frustante, pero [completamente normal](https://twitter.com/allison_horst/status/1213275783675822080?ref_src=twsrc%5Etfw%7Ctwcamp%5Etweetembed%7Ctwterm%5E1213275783675822080%7Ctwgr%5E%7Ctwcon%5Es1_&ref_url=https%3A%2F%2Fperezp44.github.io%2Fintro-ds-21-22-web%2Ftutoriales%2Ftt_02_primeros-pasos-con-R.html) !!!!!!]

]

--
.pull-right[

#### ... mejor dejarse llevar

<img src="data:image/png;base64,#./imagenes/ss_03_img_02_baby-surf.jpg" width="95%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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class: center

#####  2. Igual, sólo igual, nos hace falta otra forma de aprender (WTF!!!)

- Creo que [este video](https://www.youtube.com/watch?v=_5LhYsKpOOA) os puede ayudar.

- [Aquí](https://jakevdp.github.io/PythonDataScienceHandbook/01.01-help-and-documentation.html) señalan que: Being an effective practitioner of DS is **less about memorizing** the tool or command you should use for every possible situation, and **more about learning to effectively find the information you don't know**, whether through a web search engine or another means.

- Es decir, hay que saber **buscar ayuda**, por ejemplo [aquí](https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552336-Getting-Help-with-R) o [aquí](https://www.r-project.org/help.html), lo explican bien. Un [ejemplo](https://twitter.com/MaxPrimbs/status/1514544495349612546)

.pull-left[

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]

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background-image: url(data:image/png;base64,#imagenes/ss_03_img_02_baby-surf.jpg)
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### Vengaaaa, vamos allá!!!!